Городок Скайсткалне расположен на юге Латвии на самой границе с Литвой. Из столицы Латвии Риги туда можно добраться по шоссе Рига-Скайсткалне-Биржай.
По южной окраине этого городка протекает река, называемая по-латышски Мемеле,а по-литовски Нямунелис. Через эту реку переброшен мост, на другой стороне которого уже находится литовский поселок Германишкис.